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1、房屋的产权不同。房改房的产权属于个人所有，这意味着购房者拥有房屋的完全产权，可以自由出售、抵押、继承等。而经济适用房的产权属于政府所有，购房者只拥有房屋的使用权，不能自由出售、抵押等。
2、房屋出售后的收益权不同。房改房出售后的收益归个人所有，这意味着购房者在出售房改房时，除了缴纳相关税费外，还可以获得房屋出售的全部收益。而经济适用房出售后的收益归政府所有，购房者在出售经济适用房时，只能按照政府规定的价格进行出售，并且不能获得房屋出售的全部收益。
房改房的过户流程
1、买卖双方进行沟通。买方了解房屋整体现状及产权状况之后，可要求卖方提供合法的证件，包括房屋所有权证书、身份证件及其它证件。
2、签订《房屋买卖合同》。双方沟通一致后，买方交纳购房定金，双方签订房屋买卖合同。双方在对房屋坐落位置、产权状况及成交价格、房屋交付时间、房屋交付、产权办理等达成一致意见后，签订至少一式三份的房屋买卖合同。
3、提交审查。买卖双方共同向房地产交易管理部门提出申请，接受审查。买卖双方向房地产管理部门提出申请手续后，管理部门要查验有关证件，审查产权，对符合条件的房屋准予办理过户手续，对无产权或部分产权又未得到其他产权共有人书面同意的情况拒绝申请。
4、办理立契手续。房地产交易管理部门根据交易房屋的产权状况和购买对象，按交易部门事先设定的审批权限逐级申报审核批准后，交易双方才能办理立契手续。
5、缴纳税费。房产交易需要缴纳一定的税费，但是其构成比较复杂，要根据交易房屋的性质而定，房改房过户一般要缴纳土地出让金、个人所得税、印花税等费用。
6、办理产权转移过户手续。交易双方在房地产交易管理部门办理完产权变更登记后，交易材料移送到发证部门，买方凭领取房屋所有权证通知单到发证部门申领新的产权证。
7、申请银行贷款。买卖双方共同到贷款银行办理贷款手续，银行审核买方的资信，对双方欲交易的房屋进行评估，以确定买方的贷款额度，然后批准买方的贷款，待双方完成产权登记变更，买方领取房屋所有权证后，银行将贷款一次性发放。
8、交付房屋。买方领取房屋所有权证、付清所有房款，卖方交付房屋并结清所有物业费，将房屋钥匙交给买方，交易完毕。
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